Η Εταιρεία Ειδικού Σκοπού ΒΙΠΑ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ Α.Ε δημιουργήθηκε το Σεπτέμβριο του 2000 με στόχο την ανάπτυξη ενός βιομηχανικού πάρκου υπό το όνομα Βιομηχανικό Πάρκο Θεσσαλονίκης (ΒΙΠΑΘΕ) στην περιοχή της Κάτω Γέφυρας του Αγίου Αθανασίου Θεσσαλονίκης.
Τα έργα υποδομής στο ΒΙΠΑΘΕ ολοκληρώθηκαν από την ΤΕΡΝΑ ΑΕ και τα εγκαίνια πραγματοποιήθηκαν τον Νοέμβριο του 2008 και το Πάρκο εντάχθηκε στις διατάξεις του Ν.2545/97 για τα ΒΙ.ΠΑ..
Το 2009 η διοίκηση και διαχείριση του ΒΙΠΑΘΕ πέρασε με το ΦΕΚ320/15.1.2009 από την Εταιρεία Ανάπτυξης ΒΙΠΑΘΕ ΑΕ στην Εταιρεία Διοίκησης και Διαχείρισης ΔΕΠΠΑΘΕ ΑΕ.
Σκοπός της Εταιρείας είναι η εξασφάλιση της εύρυθμης λειτουργίας των υποδομών του Πάρκου, η οικονομική διαχείριση των εγκαταστάσεων και γενικότερα της περιουσίας του ΕΠΠΑΘΕ, ο διαμοιρασμός των κοινοχρήστων δαπανών στους χρήστες και η προάσπιση των συμφερόντων των εγκατεστημένων εταιρειών - μετόχων της ΔΕΠΠΑΘΕ ΑΕ.
Μετά την ένταξη του Πάρκου στον Νόμο 3982/2011 το Βιομηχανικό Πάρκο Θεσσαλονίκης (ΒΙΠΑΘΕ) μετονομάστηκε σε Επιχειρηματικό Πάρκο Θεσσαλονίκης (ΕΠΠΑΘΕ) και χαρακτηρίστηκε ως Πάρκο Κατηγορίας Β με το ΦΕΚ 2335 β’/20.9.2013.
Το 2024 το ΕΠΠΑΘΕ υπήχθη στον νέο Νόμο για τα Επιχειρηματικά Πάρκα, τον Ν4982/2022 και με το ΦΕΚ 4073β’/11.7.2024 χαρακτηρίστηκε ως Πάρκο Κατηγορίας Α2.